Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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