Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDE7AQ13946 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms