Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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