Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL1Q13616 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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