Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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