Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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DNASE1L3Q13609 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNASE1L3Q13609 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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