Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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