Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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