Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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