Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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