Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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