Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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