Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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