Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBQ06643 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms