Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms