Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms