Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms