Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms