Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVK-16P61578 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVK-16P61578 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms