Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms