Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms