Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PROK1P58294 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PROK1P58294 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PROK1P58294 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PROK1P58294 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms