Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN15P56746 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms