Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms