Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms