Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms