Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX2P50458 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX2P50458 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX2P50458 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX2P50458 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX2P50458 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX2P50458 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX2P50458 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX2P50458 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX2P50458 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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