Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF6P49848 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF6P49848 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF6P49848 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF6P49848 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF6P49848 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms