Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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