Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP2P42575 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP2P42575 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms