Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP3P42574 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP3P42574 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP3P42574 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP3P42574 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP3P42574 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms