Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms