Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms