Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms