Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms