Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms