Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP6P35125 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP6P35125 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP6P35125 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP6P35125 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms