Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms