Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TSPOP30536 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms