Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNTFRP26992 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNTFRP26992 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms