Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD27P26842 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD27P26842 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD27P26842 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD27P26842 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD27P26842 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD27P26842 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD27P26842 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD27P26842 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms