Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms