Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTSSP25774 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTSSP25774 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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