Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms