Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRBP23467 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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