Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms