Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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