Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD53P19397 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD53P19397 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD53P19397 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms