Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA2P17301 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms