Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB1P14653 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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